BLASTN 2.2.5 [Nov-16-2002]
Reference:
Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schäffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= pgp1n.pk001.m1
(226 letters)
Database: All GenBank+EMBL+DDBJ+PDB sequences (but no EST, STS,
GSS, or phase 0, 1 or 2 HTGS sequences)
1,542,558 sequences; -1,032,325,967 total letters
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
emb|AL732390.10| Mouse DNA sequence from clone RP23-413O19 ... 186 9e-045
gb|AC124078.5| Homo sapiens chromosome 11, clone RP1-59M18,... 178 2e-042
emb|AL732467.7| Mouse DNA sequence from clone RP23-147L14 o... 178 2e-042
emb|AL589766.17| Mouse DNA sequence from clone RP23-19G4 on... 178 2e-042
gb|AC121831.3| Mus musculus chromosome 2 clone RP24-66F17, ... 176 9e-042
gb|AY149282.1| Mus musculus sodium-dependent orphan neurotr... 176 9e-042
emb|AL833778.5| Mouse DNA sequence from clone RP23-404M22 o... 176 9e-042
emb|AL731731.14| Mouse DNA sequence from clone RP23-331L13 ... 176 9e-042
emb|AL163280.2|HS21C080 Homo sapiens chromosome 21 segment ... 176 9e-042
emb|AL670285.10| Mouse DNA sequence from clone RP23-308N2 o... 176 9e-042
>emb|AL732390.10| Mouse DNA sequence from clone RP23-413O19 on chromosome 11, complete
sequence
Length = 195612
Score = 186 bits (94), Expect = 9e-045
Identities = 94/94 (100%)
Strand = Plus / Minus
Query: 129 ccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttc 188
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 8185 ccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttc 8126
Query: 189 ccttcccttcccttccctttcccttcccttccct 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 8125 ccttcccttcccttccctttcccttcccttccct 8092
Score = 170 bits (86), Expect = 5e-040
Identities = 92/94 (97%)
Strand = Plus / Minus
Query: 129 ccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttc 188
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 8190 ccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttc 8131
Query: 189 ccttcccttcccttccctttcccttcccttccct 222
||||||||||||||||||| || |||||||||||
Sbjct: 8130 ccttcccttcccttcccttccctttcccttccct 8097
Score = 170 bits (86), Expect = 5e-040
Identities = 93/94 (98%), Gaps = 1/94 (1%)
Strand = Plus / Minus
Query: 129 ccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttc 188
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 8225 ccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttc 8166
Query: 189 ccttcccttcccttccctttcccttcccttccct 222
||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 8165 ccttcccttcccttccc-ttcccttcccttccct 8133
Score = 170 bits (86), Expect = 5e-040
Identities = 92/94 (97%)
Strand = Plus / Minus
Query: 129 ccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttc 188
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 8180 ccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttc 8121
Query: 189 ccttcccttcccttccctttcccttcccttccct 222
|||||||||||||| || ||||||||||||||||
Sbjct: 8120 ccttcccttccctttcccttcccttcccttccct 8087
Score = 170 bits (86), Expect = 5e-040
Identities = 93/94 (98%), Gaps = 1/94 (1%)
Strand = Plus / Minus
Query: 129 ccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttc 188
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 8230 ccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttc 8171
Query: 189 ccttcccttcccttccctttcccttcccttccct 222
||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 8170 ccttcccttcccttccc-ttcccttcccttccct 8138
Score = 170 bits (86), Expect = 5e-040
Identities = 93/94 (98%), Gaps = 1/94 (1%)
Strand = Plus / Minus
Query: 129 ccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttc 188
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 8210 ccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttc 8151
Query: 189 ccttcccttcccttccctttcccttcccttccct 222
||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 8150 ccttcccttcccttccc-ttcccttcccttccct 8118
Score = 168 bits (85), Expect = 2e-039
Identities = 92/93 (98%), Gaps = 1/93 (1%)
Strand = Plus / Minus
Query: 130 cttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcc 189
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 8234 cttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcc 8175
Query: 190 cttcccttcccttccctttcccttcccttccct 222
|||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 8174 cttcccttcccttccc-ttcccttcccttccct 8143
Score = 163 bits (82), Expect = 1e-037
Identities = 89/90 (98%), Gaps = 1/90 (1%)
Strand = Plus / Minus
Query: 129 ccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttc 188
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 8195 ccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttc 8136
Query: 189 ccttcccttcccttccctttcccttccctt 218
||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct: 8135 ccttcccttcccttccc-ttcccttccctt 8107
Score = 157 bits (79), Expect = 8e-036
Identities = 93/95 (97%), Gaps = 2/95 (2%)
Strand = Plus / Minus
Query: 129 ccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttccctt-cccttccctt 187
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
Sbjct: 8155 ccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttccctttcccttccctt 8096
Query: 188 cccttcccttcccttccctttcccttcccttccct 222
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct: 8095 cccttcccttcccttccctt-cccttcccttccct 8062
Score = 157 bits (79), Expect = 8e-036
Identities = 93/95 (97%), Gaps = 2/95 (2%)
Strand = Plus / Minus
Query: 129 ccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttccctt- 187
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 8165 ccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttt 8106
Query: 188 cccttcccttcccttccctttcccttcccttccct 222
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct: 8105 cccttcccttcccttccctt-cccttcccttccct 8072
Score = 157 bits (79), Expect = 8e-036
Identities = 93/95 (97%), Gaps = 2/95 (2%)
Strand = Plus / Minus
Query: 129 ccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttc 188
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 8170 ccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttc 8111
Query: 189 cctt-cccttcccttccctttcccttcccttccct 222
|||| ||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct: 8110 cctttcccttcccttccctt-cccttcccttccct 8077
Score = 157 bits (79), Expect = 8e-036
Identities = 93/95 (97%), Gaps = 2/95 (2%)
Strand = Plus / Minus
Query: 129 ccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttc 188
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 8175 ccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttc 8116
Query: 189 ccttccctt-cccttccctttcccttcccttccct 222
||||||||| |||||||||| ||||||||||||||
Sbjct: 8115 ccttccctttcccttccctt-cccttcccttccct 8082
Score = 143 bits (72), Expect = 1e-031
Identities = 79/80 (98%), Gaps = 1/80 (1%)
Strand = Plus / Minus
Query: 129 ccttcccttcccttcccttcccttcccttccctt-cccttcccttcccttcccttccctt 187
|||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 8140 ccttcccttcccttcccttcccttcccttccctttcccttcccttcccttcccttccctt 8081
Query: 188 cccttcccttcccttccctt 207
||||||||||||||||||||
Sbjct: 8080 cccttcccttcccttccctt 8061
Score = 135 bits (68), Expect = 3e-029
Identities = 75/76 (98%), Gaps = 1/76 (1%)
Strand = Plus / Minus
Query: 129 ccttcccttcccttcccttcccttccctt-cccttcccttcccttcccttcccttccctt 187
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 8135 ccttcccttcccttcccttcccttccctttcccttcccttcccttcccttcccttccctt 8076
Query: 188 cccttcccttcccttc 203
||||||||||||||||
Sbjct: 8075 cccttcccttcccttc 8060
Score = 111 bits (56), Expect = 4e-022
Identities = 88/95 (92%), Gaps = 4/95 (4%)
Strand = Plus / Minus
Query: 129 ccttcccttcccttcccttcccttcccttc-ccttcccttcccttcccttcccttccctt 187
||||| ||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct: 8284 ccttctcttcccttctcttcccttcccttctctttcccttcccttccctt--cttccctt 8227
Query: 188 cccttcccttcccttccctttcccttcccttccct 222
|||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 8226 cccttcccttcccttccc-ttcccttcccttccct 8193
Score = 107 bits (54), Expect = 7e-021
Identities = 86/93 (92%), Gaps = 4/93 (4%)
Strand = Plus / Minus
Query: 131 ttcccttcccttcccttcccttcccttcccttc-ccttcccttcccttcccttcccttcc 189
|||||||| ||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||
Sbjct: 8287 ttcccttctcttcccttctcttcccttcccttctctttcccttcccttccctt--cttcc 8230
Query: 190 cttcccttcccttccctttcccttcccttccct 222
|||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 8229 cttcccttcccttccc-ttcccttcccttccct 8198
>gb|AC124078.5| Homo sapiens chromosome 11, clone RP1-59M18, complete sequence
Length = 177543
Score = 178 bits (90), Expect = 2e-042
Identities = 93/94 (98%)
Strand = Plus / Minus
Query: 129 ccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttc 188
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 116857 ccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttc 116798
Query: 189 ccttcccttcccttccctttcccttcccttccct 222
||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct: 116797 ccttcccttcccttcccttacccttcccttccct 116764
Score = 163 bits (82), Expect = 1e-037
Identities = 88/90 (97%)
Strand = Plus / Minus
Query: 129 ccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttc 188
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 116852 ccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttc 116793
Query: 189 ccttcccttcccttccctttcccttccctt 218
|||||||||||||| || ||||||||||||
Sbjct: 116792 ccttcccttcccttacccttcccttccctt 116763
Score = 163 bits (82), Expect = 1e-037
Identities = 91/94 (96%)
Strand = Plus / Minus
Query: 129 ccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttc 188
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 116862 ccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttc 116803
Query: 189 ccttcccttcccttccctttcccttcccttccct 222
||||||||||||||||||| || | |||||||||
Sbjct: 116802 ccttcccttcccttcccttcccttacccttccct 116769
Score = 161 bits (81), Expect = 5e-037
Identities = 88/89 (98%), Gaps = 1/89 (1%)
Strand = Plus / Minus
Query: 130 cttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcc 189
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 116866 cttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcc 116807
Query: 190 cttcccttcccttccctttcccttccctt 218
|||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct: 116806 cttcccttcccttccc-ttcccttccctt 116779
Score = 95.6 bits (48), Expect = 3e-017
Identities = 91/99 (91%), Gaps = 6/99 (6%)
Strand = Plus / Minus
Query: 129 ccttcccttccc-ttcccttccctt--cccttcccttccc-ttcccttccc-ttcccttc 183
|||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| ||||||||
Sbjct: 116577 ccttcccttccccttcccttccccttccccttcccttccccttcccttccccttcccttc 116518
Query: 184 ccttccc-ttcccttcccttccctttcccttcccttccc 221
||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct: 116517 ccttccccttcccttcccttccccttcccttcccttccc 116479
Score = 95.6 bits (48), Expect = 3e-017
Identities = 91/99 (91%), Gaps = 6/99 (6%)
Strand = Plus / Minus
Query: 129 ccttcccttccctt--cccttcccttccc-ttcccttccc-ttcccttcccttccc-ttc 183
|||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||
Sbjct: 116566 ccttcccttccccttccccttcccttccccttcccttccccttcccttcccttccccttc 116507
Query: 184 ccttcccttccc-ttcccttccctttcccttcccttccc 221
|||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||
Sbjct: 116506 ccttcccttccccttcccttcccttccccttcccttccc 116468
Score = 89.7 bits (45), Expect = 2e-015
Identities = 88/96 (91%), Gaps = 6/96 (6%)
Strand = Plus / Minus
Query: 133 cccttcccttccc-ttcccttccctt--cccttcccttccc-ttcccttccc-ttccctt 187
||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| |||||||
Sbjct: 116578 cccttcccttccccttcccttccccttccccttcccttccccttcccttccccttccctt 116519
Query: 188 cccttccc-ttcccttccctttcccttcccttccct 222
|||||||| |||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct: 116518 cccttccccttcccttcccttccccttcccttccct 116483
Score = 87.7 bits (44), Expect = 6e-015
Identities = 87/95 (91%), Gaps = 6/95 (6%)
Strand = Plus / Minus
Query: 133 cccttcccttccc-ttcccttccc-ttcccttccctt--cccttcccttccc-ttccctt 187
||||||||||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| |||||||
Sbjct: 116589 cccttcccttccccttcccttccccttcccttccccttccccttcccttccccttccctt 116530
Query: 188 ccc-ttcccttcccttccctttcccttcccttccc 221
||| ||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct: 116529 ccccttcccttcccttccccttcccttcccttccc 116495
Score = 85.7 bits (43), Expect = 2e-014
Identities = 81/87 (93%), Gaps = 5/87 (5%)
Strand = Plus / Minus
Query: 129 ccttcccttccc-ttcccttccc-ttcccttcccttccc-ttcccttcccttccc-ttcc 184
|||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||
Sbjct: 116549 ccttcccttccccttcccttccccttcccttcccttccccttcccttcccttccccttcc 116490
Query: 185 cttcccttccc-ttcccttccctttcc 210
||||||||||| |||||||||| ||||
Sbjct: 116489 cttcccttccccttcccttccccttcc 116463
Score = 79.8 bits (40), Expect = 1e-012
Identities = 83/91 (91%), Gaps = 6/91 (6%)
Strand = Plus / Minus
Query: 138 cccttcccttccc-ttcccttccc-ttcccttccctt--cccttcccttccc-ttccctt 192
||||||||||||| |||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| |||||||
Sbjct: 116589 cccttcccttccccttcccttccccttcccttccccttccccttcccttccccttccctt 116530
Query: 193 ccc-ttcccttccctttcccttcccttccct 222
||| |||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct: 116529 ccccttcccttcccttccccttcccttccct 116499
Score = 79.8 bits (40), Expect = 1e-012
Identities = 88/96 (91%), Gaps = 6/96 (6%)
Strand = Plus / Minus
Query: 133 cccttcccttccctt-cccttccctt-cccttccctt-cccttccctt-cccttccctt- 187
||||||||||||||| ||||||| || |||||||||| |||||||||| ||||||||||
Sbjct: 116777 cccttcccttcccttacccttccgttacccttcccttacccttcccttacccttccctta 116718
Query: 188 cccttccctt-cccttccctttcccttcccttccct 222
|||||||||| |||||||||| ||||||||||||||
Sbjct: 116717 cccttcccttacccttcccttacccttcccttccct 116682
Score = 71.9 bits (36), Expect = 4e-010
Identities = 87/96 (90%), Gaps = 6/96 (6%)
Strand = Plus / Minus
Query: 129 ccttcccttccctt-cccttccctt-cccttccctt-cccttccctt-cccttccctt-c 183
|||||||||||||| ||||||| || |||||||||| |||||||||| |||||||||| |
Sbjct: 116776 ccttcccttcccttacccttccgttacccttcccttacccttcccttacccttcccttac 116717
Query: 184 ccttccctt-cccttcccttccctttcccttccctt 218
||||||||| |||||||||| || ||||||||||||
Sbjct: 116716 ccttcccttacccttcccttacccttcccttccctt 116681
Score = 67.9 bits (34), Expect = 6e-009
Identities = 72/78 (92%), Gaps = 5/78 (6%)
Strand = Plus / Minus
Query: 143 cccttccctt-cccttccctt-cccttccctt-cccttccctt-cccttccctt-ccctt 197
|||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||
Sbjct: 116750 cccttcccttacccttcccttacccttcccttacccttcccttacccttcccttaccctt 116691
Query: 198 cccttccctttcccttcc 215
|||||||||| |||||||
Sbjct: 116690 cccttcccttacccttcc 116673
>emb|AL732467.7| Mouse DNA sequence from clone RP23-147L14 on chromosome 2, complete
sequence
Length = 229048
Score = 178 bits (90), Expect = 2e-042
Identities = 93/94 (98%)
Strand = Plus / Plus
Query: 129 ccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttc 188
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 60166 ccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttc 60225
Query: 189 ccttcccttcccttccctttcccttcccttccct 222
||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct: 60226 ccttcccttcccttcccttccccttcccttccct 60259
Score = 178 bits (90), Expect = 2e-042
Identities = 93/94 (98%)
Strand = Plus / Plus
Query: 129 ccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttc 188
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 60171 ccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttc 60230
Query: 189 ccttcccttcccttccctttcccttcccttccct 222
||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 60231 ccttcccttcccttccccttcccttcccttccct 60264
Score = 170 bits (86), Expect = 5e-040
Identities = 93/94 (98%), Gaps = 1/94 (1%)
Strand = Plus / Plus
Query: 129 ccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttc 188
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 60091 ccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttc 60150
Query: 189 ccttcccttcccttccctttcccttcccttccct 222
||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 60151 ccttcccttcccttccc-ttcccttcccttccct 60183
Score = 170 bits (86), Expect = 5e-040
Identities = 93/94 (98%), Gaps = 1/94 (1%)
Strand = Plus / Plus
Query: 129 ccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttc 188
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 60101 ccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttc 60160
Query: 189 ccttcccttcccttccctttcccttcccttccct 222
||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 60161 ccttcccttcccttccc-ttcccttcccttccct 60193
Score = 170 bits (86), Expect = 5e-040
Identities = 93/94 (98%), Gaps = 1/94 (1%)
Strand = Plus / Plus
Query: 129 ccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttc 188
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 60106 ccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttc 60165
Query: 189 ccttcccttcccttccctttcccttcccttccct 222
||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 60166 ccttcccttcccttccc-ttcccttcccttccct 60198
Score = 170 bits (86), Expect = 5e-040
Identities = 93/94 (98%), Gaps = 1/94 (1%)
Strand = Plus / Plus
Query: 129 ccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttc 188
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 60121 ccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttc 60180
Query: 189 ccttcccttcccttccctttcccttcccttccct 222
||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 60181 ccttcccttcccttccc-ttcccttcccttccct 60213
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Sbjct: 60191 ccttcccttcccttccc-ttcccttcccttccct 60223
Score = 170 bits (86), Expect = 5e-040
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Strand = Plus / Plus
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Sbjct: 60146 ccttcccttcccttccc-ttcccttcccttccct 60178
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Strand = Plus / Plus
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Strand = Plus / Plus
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Strand = Plus / Plus
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Query: 188 cccttcccttcccttccctttcccttcccttccct 222
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||
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Identities = 93/95 (97%), Gaps = 2/95 (2%)
Strand = Plus / Plus
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Sbjct: 60216 ccttcccttcccttcccttcccttcccttccccttcccttcccttcccttcccttccctt 60275
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|||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct: 60276 cccttcccttcccttccctt-cccttcccttccct 60309
Score = 157 bits (79), Expect = 8e-036
Identities = 93/95 (97%), Gaps = 2/95 (2%)
Strand = Plus / Plus
Query: 129 ccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttccc-ttcccttcccttcccttccctt 187
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Sbjct: 60211 ccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttccccttcccttcccttcccttccctt 60270
Query: 188 cccttcccttcccttccctttcccttcccttccct 222
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct: 60271 cccttcccttcccttccctt-cccttcccttccct 60304
Score = 157 bits (79), Expect = 8e-036
Identities = 93/95 (97%), Gaps = 2/95 (2%)
Strand = Plus / Plus
Query: 129 ccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttccc-ttcccttcccttccctt 187
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Sbjct: 60206 ccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttccccttcccttcccttccctt 60265
Query: 188 cccttcccttcccttccctttcccttcccttccct 222
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct: 60266 cccttcccttcccttccctt-cccttcccttccct 60299
Score = 157 bits (79), Expect = 8e-036
Identities = 93/95 (97%), Gaps = 2/95 (2%)
Strand = Plus / Plus
Query: 129 ccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttccc-ttcccttccctt 187
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Sbjct: 60201 ccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttccccttcccttccctt 60260
Query: 188 cccttcccttcccttccctttcccttcccttccct 222
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct: 60261 cccttcccttcccttccctt-cccttcccttccct 60294
Score = 157 bits (79), Expect = 8e-036
Identities = 93/95 (97%), Gaps = 2/95 (2%)
Strand = Plus / Plus
Query: 129 ccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttccc-ttccctt 187
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Sbjct: 60196 ccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttccccttccctt 60255
Query: 188 cccttcccttcccttccctttcccttcccttccct 222
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct: 60256 cccttcccttcccttccctt-cccttcccttccct 60289
Score = 157 bits (79), Expect = 8e-036
Identities = 93/95 (97%), Gaps = 2/95 (2%)
Strand = Plus / Plus
Query: 129 ccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttccc-tt 187
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct: 60191 ccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccctt 60250
Query: 188 cccttcccttcccttccctttcccttcccttccct 222
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct: 60251 cccttcccttcccttccctt-cccttcccttccct 60284
Score = 157 bits (79), Expect = 8e-036
Identities = 93/95 (97%), Gaps = 2/95 (2%)
Strand = Plus / Plus
Query: 129 ccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttc 188
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Sbjct: 60186 ccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttc 60245
Query: 189 cc-ttcccttcccttccctttcccttcccttccct 222
|| ||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct: 60246 cccttcccttcccttccctt-cccttcccttccct 60279
Score = 157 bits (79), Expect = 8e-036
Identities = 93/95 (97%), Gaps = 2/95 (2%)
Strand = Plus / Plus
Query: 129 ccttcccttcccttcccttcccttccc-ttcccttcccttcccttcccttcccttccctt 187
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 60221 ccttcccttcccttcccttcccttccccttcccttcccttcccttcccttcccttccctt 60280
Query: 188 cccttcccttcccttccctttcccttcccttccct 222
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct: 60281 cccttcccttcccttccctt-cccttcccttccct 60314
Score = 151 bits (76), Expect = 5e-034
Identities = 76/76 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 133 cccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttccctt 192
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 60246 cccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttccctt 60305
Query: 193 cccttcccttcccttt 208
||||||||||||||||
Sbjct: 60306 cccttcccttcccttt 60321
Score = 147 bits (74), Expect = 8e-033
Identities = 74/74 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 129 ccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttc 188
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 60247 ccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttc 60306
Query: 189 ccttcccttccctt 202
||||||||||||||
Sbjct: 60307 ccttcccttccctt 60320
>emb|AL589766.17| Mouse DNA sequence from clone RP23-19G4 on chromosome 13, complete
sequence
Length = 176183
Score = 178 bits (90), Expect = 2e-042
Identities = 97/98 (98%), Gaps = 1/98 (1%)
Strand = Plus / Plus
Query: 125 gcttccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcc 184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 86593 gcttccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcc 86652
Query: 185 cttcccttcccttcccttccctttcccttcccttccct 222
||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 86653 cttcccttcccttcccttccc-ttcccttcccttccct 86689
Score = 170 bits (86), Expect = 5e-040
Identities = 93/94 (98%), Gaps = 1/94 (1%)
Strand = Plus / Plus
Query: 129 ccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttc 188
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 86607 ccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttc 86666
Query: 189 ccttcccttcccttccctttcccttcccttccct 222
||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct: 86667 ccttcccttcccttccctt-cccttcccttccct 86699
Score = 170 bits (86), Expect = 5e-040
Identities = 93/94 (98%), Gaps = 1/94 (1%)
Strand = Plus / Plus
Query: 129 ccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttc 188
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 86602 ccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttc 86661
Query: 189 ccttcccttcccttccctttcccttcccttccct 222
||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct: 86662 ccttcccttcccttccctt-cccttcccttccct 86694
Score = 165 bits (83), Expect = 3e-038
Identities = 90/91 (98%), Gaps = 1/91 (1%)
Strand = Plus / Plus
Query: 129 ccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttc 188
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 86612 ccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttc 86671
Query: 189 ccttcccttcccttccctttcccttcccttc 219
||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct: 86672 ccttcccttcccttccc-ttcccttcccttc 86701
>gb|AC121831.3| Mus musculus chromosome 2 clone RP24-66F17, complete sequence
Length = 190963
Score = 176 bits (89), Expect = 9e-042
Identities = 96/97 (98%), Gaps = 1/97 (1%)
Strand = Plus / Minus
Query: 126 cttccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttccc 185
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 94422 cttccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttccc 94363
Query: 186 ttcccttcccttcccttccctttcccttcccttccct 222
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 94362 ttcccttcccttcccttccc-ttcccttcccttccct 94327
Score = 147 bits (74), Expect = 8e-033
Identities = 77/78 (98%)
Strand = Plus / Minus
Query: 129 ccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttc 188
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 94399 ccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttc 94340
Query: 189 ccttcccttcccttccct 206
||||||||||||| ||||
Sbjct: 94339 ccttcccttccctcccct 94322
Score = 139 bits (70), Expect = 2e-030
Identities = 76/78 (97%)
Strand = Plus / Minus
Query: 129 ccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttc 188
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 94394 ccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttc 94335
Query: 189 ccttcccttcccttccct 206
|||||||| |||| ||||
Sbjct: 94334 ccttccctcccctcccct 94317
Score = 131 bits (66), Expect = 5e-028
Identities = 75/78 (96%)
Strand = Plus / Minus
Query: 129 ccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttc 188
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 94389 ccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttc 94330
Query: 189 ccttcccttcccttccct 206
||| |||| |||| ||||
Sbjct: 94329 cctcccctcccctcccct 94312
Score = 123 bits (62), Expect = 1e-025
Identities = 74/78 (94%)
Strand = Plus / Minus
Query: 129 ccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttc 188
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct: 94384 ccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttccctcc 94325
Query: 189 ccttcccttcccttccct 206
||| |||| |||| ||||
Sbjct: 94324 cctcccctcccctcccct 94307
Score = 115 bits (58), Expect = 3e-023
Identities = 73/78 (93%)
Strand = Plus / Minus
Query: 129 ccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttc 188
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
Sbjct: 94379 ccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttccctcccctcc 94320
Query: 189 ccttcccttcccttccct 206
||| |||| |||| ||||
Sbjct: 94319 cctcccctcccctcccct 94302
Score = 107 bits (54), Expect = 7e-021
Identities = 72/78 (92%)
Strand = Plus / Minus
Query: 129 ccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttc 188
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |
Sbjct: 94374 ccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttccctcccctcccctcc 94315
Query: 189 ccttcccttcccttccct 206
||| |||| |||| ||||
Sbjct: 94314 cctcccctcccctcccct 94297
Score = 99.6 bits (50), Expect = 2e-018
Identities = 71/78 (91%)
Strand = Plus / Minus
Query: 129 ccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttc 188
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||| |
Sbjct: 94369 ccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttccctcccctcccctcccctcc 94310
Query: 189 ccttcccttcccttccct 206
||| |||| |||| ||||
Sbjct: 94309 cctcccctcccctcccct 94292
Score = 91.7 bits (46), Expect = 4e-016
Identities = 70/78 (89%)
Strand = Plus / Minus
Query: 129 ccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttc 188
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||| |||| |
Sbjct: 94364 ccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttccctcccctcccctcccctcccctcc 94305
Query: 189 ccttcccttcccttccct 206
||| |||| |||| ||||
Sbjct: 94304 cctcccctcccctcccct 94287
Score = 83.8 bits (42), Expect = 1e-013
Identities = 69/78 (88%)
Strand = Plus / Minus
Query: 129 ccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttc 188
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||| |||| |||| |
Sbjct: 94359 ccttcccttcccttcccttcccttcccttccctcccctcccctcccctcccctcccctcc 94300
Query: 189 ccttcccttcccttccct 206
||| |||| |||| ||||
Sbjct: 94299 cctcccctcccctcccct 94282
Score = 75.8 bits (38), Expect = 2e-011
Identities = 68/78 (87%)
Strand = Plus / Minus
Query: 129 ccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttc 188
|||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||| |||| |||| |||| |
Sbjct: 94354 ccttcccttcccttcccttcccttccctcccctcccctcccctcccctcccctcccctcc 94295
Query: 189 ccttcccttcccttccct 206
||| |||| |||| ||||
Sbjct: 94294 cctcccctcccctcccct 94277
Score = 67.9 bits (34), Expect = 6e-009
Identities = 67/78 (85%)
Strand = Plus / Minus
Query: 129 ccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttc 188
||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||| |||| |||| |||| |||| |
Sbjct: 94349 ccttcccttcccttcccttccctcccctcccctcccctcccctcccctcccctcccctcc 94290
Query: 189 ccttcccttcccttccct 206
||| |||| |||| ||||
Sbjct: 94289 cctcccctcccctcccct 94272
Score = 60.0 bits (30), Expect = 1e-006
Identities = 66/78 (84%)
Strand = Plus / Minus
Query: 129 ccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttc 188
|||||||||||||||||| |||| |||| |||| |||| |||| |||| |||| |||| |
Sbjct: 94344 ccttcccttcccttccctcccctcccctcccctcccctcccctcccctcccctcccctcc 94285
Query: 189 ccttcccttcccttccct 206
||| |||| |||| ||||
Sbjct: 94284 cctcccctcccctcccct 94267
>gb|AY149282.1| Mus musculus sodium-dependent orphan neurotransmitter transporter V73
(V73) gene, complete cds; alternatively spliced
Length = 59839
Score = 176 bits (89), Expect = 9e-042
Identities = 96/97 (98%), Gaps = 1/97 (1%)
Strand = Plus / Plus
Query: 126 cttccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttccc 185
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 39402 cttccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttccc 39461
Query: 186 ttcccttcccttcccttccctttcccttcccttccct 222
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 39462 ttcccttcccttcccttccc-ttcccttcccttccct 39497
Score = 170 bits (86), Expect = 5e-040
Identities = 93/94 (98%), Gaps = 1/94 (1%)
Strand = Plus / Plus
Query: 129 ccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttc 188
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 39410 ccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttc 39469
Query: 189 ccttcccttcccttccctttcccttcccttccct 222
||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct: 39470 ccttcccttcccttccctt-cccttcccttccct 39502
Score = 167 bits (84), Expect = 8e-039
Identities = 91/92 (98%), Gaps = 1/92 (1%)
Strand = Plus / Plus
Query: 129 ccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttc 188
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 39415 ccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttc 39474
Query: 189 ccttcccttcccttccctttcccttcccttcc 220
||||||||||||||||||| ||||||||||||
Sbjct: 39475 ccttcccttcccttccctt-cccttcccttcc 39505
>emb|AL833778.5| Mouse DNA sequence from clone RP23-404M22 on chromosome X, complete
sequence
Length = 199554
Score = 176 bits (89), Expect = 9e-042
Identities = 96/97 (98%), Gaps = 1/97 (1%)
Strand = Plus / Plus
Query: 126 cttccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttccc 185
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Sbjct: 169493 cttccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttccc 169552
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Strand = Plus / Plus
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Sbjct: 169511 ccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttc 169570
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Sbjct: 169571 ccttcccttcccttccc-ttcccttcccttccct 169603
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Identities = 93/94 (98%), Gaps = 1/94 (1%)
Strand = Plus / Plus
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Strand = Plus / Plus
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Sbjct: 169521 ccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttc 169580
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Strand = Plus / Plus
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Sbjct: 169591 ccttcccttcccttccctt-cccttcccttccct 169623
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Identities = 76/79 (96%)
Strand = Plus / Plus
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Strand = Plus / Plus
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Strand = Plus / Plus
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Strand = Plus / Plus
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Identities = 68/72 (94%)
Strand = Plus / Plus
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|||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 24657 ttcctttcctttcctttccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttccct 24716
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Sbjct: 24717 tccctttccttc 24728
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Identities = 63/64 (98%), Gaps = 1/64 (1%)
Strand = Plus / Plus
Query: 159 ccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttccctttcccttccctt 218
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Sbjct: 132959 ccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttccctt-cccttccctt 133017
Query: 219 ccct 222
||||
Sbjct: 133018 ccct 133021
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Strand = Plus / Plus
Query: 144 ccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttc 203
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Sbjct: 24659 cctttcctttcctttccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttc 24718
Query: 204 cctttcc 210
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Sbjct: 24719 cctttcc 24725
Score = 107 bits (54), Expect = 7e-021
Identities = 72/78 (92%)
Strand = Plus / Plus
Query: 129 ccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttc 188
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Sbjct: 132974 ccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttccctcccctcccctcc 133033
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Sbjct: 133034 cctcccctcccctcccct 133051
Score = 107 bits (54), Expect = 7e-021
Identities = 66/70 (94%)
Strand = Plus / Plus
Query: 134 ccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttc 193
|||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 24659 cctttcctttcctttccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttc 24718
Query: 194 ccttcccttc 203
|||| |||||
Sbjct: 24719 cctttccttc 24728
Score = 105 bits (53), Expect = 3e-020
Identities = 65/69 (94%)
Strand = Plus / Plus
Query: 139 ccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttc 198
|||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 24659 cctttcctttcctttccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttc 24718
Query: 199 ccttccctt 207
|||| ||||
Sbjct: 24719 cctttcctt 24727
Score = 99.6 bits (50), Expect = 2e-018
Identities = 71/78 (91%)
Strand = Plus / Plus
Query: 129 ccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttc 188
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Sbjct: 132979 ccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttccctcccctcccctcccctcc 133038
Query: 189 ccttcccttcccttccct 206
||| |||| |||| ||||
Sbjct: 133039 cctcccctcccctcccct 133056
Score = 87.7 bits (44), Expect = 6e-015
Identities = 60/64 (93%), Gaps = 1/64 (1%)
Strand = Plus / Plus
Query: 159 ccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttccctttcccttccctt 218
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Sbjct: 24659 cctttcctttcctttccttcccttcccttcccttcccttcccttccctt-cccttccctt 24717
Query: 219 ccct 222
||||
Sbjct: 24718 ccct 24721
Score = 75.8 bits (38), Expect = 2e-011
Identities = 76/86 (88%), Gaps = 2/86 (2%)
Strand = Plus / Plus
Query: 129 ccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttc 188
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Sbjct: 132994 ccttcccttcccttcccttcccttccc-tcccctcccctcccctcccctcccctcccctc 133052
Query: 189 ccttcccttccc-ttccctttccctt 213
|| ||| ||||| |||||||||||||
Sbjct: 133053 ccctcctttccctttccctttccctt 133078
>emb|AL731731.14| Mouse DNA sequence from clone RP23-331L13 on chromosome X, complete
sequence
Length = 151603
Score = 176 bits (89), Expect = 9e-042
Identities = 96/97 (98%), Gaps = 1/97 (1%)
Strand = Plus / Minus
Query: 126 cttccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttccc 185
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Sbjct: 137485 cttccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttccc 137426
Query: 186 ttcccttcccttcccttccctttcccttcccttccct 222
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 137425 ttcccttcccttcccttccc-ttcccttcccttccct 137390
Score = 170 bits (86), Expect = 5e-040
Identities = 93/94 (98%), Gaps = 1/94 (1%)
Strand = Plus / Minus
Query: 129 ccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttc 188
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 137477 ccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttc 137418
Query: 189 ccttcccttcccttccctttcccttcccttccct 222
||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct: 137417 ccttcccttcccttccctt-cccttcccttccct 137385
Score = 147 bits (74), Expect = 8e-033
Identities = 77/78 (98%)
Strand = Plus / Minus
Query: 129 ccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttc 188
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 137457 ccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttc 137398
Query: 189 ccttcccttcccttccct 206
||||||||||||| ||||
Sbjct: 137397 ccttcccttccctcccct 137380
Score = 139 bits (70), Expect = 2e-030
Identities = 76/78 (97%)
Strand = Plus / Minus
Query: 129 ccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttc 188
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 137452 ccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttc 137393
Query: 189 ccttcccttcccttccct 206
|||||||| |||| ||||
Sbjct: 137392 ccttccctcccctcccct 137375
Score = 131 bits (66), Expect = 5e-028
Identities = 75/78 (96%)
Strand = Plus / Minus
Query: 129 ccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttc 188
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 137447 ccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttc 137388
Query: 189 ccttcccttcccttccct 206
||| |||| |||| ||||
Sbjct: 137387 cctcccctcccctcccct 137370
Score = 123 bits (62), Expect = 1e-025
Identities = 74/78 (94%)
Strand = Plus / Minus
Query: 129 ccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttc 188
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct: 137442 ccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttccctcc 137383
Query: 189 ccttcccttcccttccct 206
||| |||| |||| ||||
Sbjct: 137382 cctcccctcccctcccct 137365
Score = 115 bits (58), Expect = 3e-023
Identities = 73/78 (93%)
Strand = Plus / Minus
Query: 129 ccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttc 188
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |
Sbjct: 137437 ccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttccctcccctcc 137378
Query: 189 ccttcccttcccttccct 206
||| |||| |||| ||||
Sbjct: 137377 cctcccctcccctcccct 137360
Score = 107 bits (54), Expect = 7e-021
Identities = 72/78 (92%)
Strand = Plus / Minus
Query: 129 ccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttc 188
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |
Sbjct: 137432 ccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttccctcccctcccctcc 137373
Query: 189 ccttcccttcccttccct 206
||| |||| |||| ||||
Sbjct: 137372 cctcccctcccctcccct 137355
Score = 99.6 bits (50), Expect = 2e-018
Identities = 71/78 (91%)
Strand = Plus / Minus
Query: 129 ccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttc 188
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||| |
Sbjct: 137427 ccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttccctcccctcccctcccctcc 137368
Query: 189 ccttcccttcccttccct 206
||| |||| |||| ||||
Sbjct: 137367 cctcccctcccctcccct 137350
Score = 67.9 bits (34), Expect = 6e-009
Identities = 34/34 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 176 ttcccttcccttcccttcccttcccttccctttc 209
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Sbjct: 110019 ttcccttcccttcccttcccttcccttccctttc 110052
Score = 63.9 bits (32), Expect = 9e-008
Identities = 32/32 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 146 ttcccttcccttcccttcccttcccttccctt 177
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Sbjct: 110019 ttcccttcccttcccttcccttcccttccctt 110050
Score = 63.9 bits (32), Expect = 9e-008
Identities = 32/32 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 166 ttcccttcccttcccttcccttcccttccctt 197
||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 110019 ttcccttcccttcccttcccttcccttccctt 110050
Score = 63.9 bits (32), Expect = 9e-008
Identities = 32/32 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 141 ttcccttcccttcccttcccttcccttccctt 172
||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 110019 ttcccttcccttcccttcccttcccttccctt 110050
Score = 63.9 bits (32), Expect = 9e-008
Identities = 32/32 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 161 ttcccttcccttcccttcccttcccttccctt 192
||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 110019 ttcccttcccttcccttcccttcccttccctt 110050
Score = 63.9 bits (32), Expect = 9e-008
Identities = 32/32 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 171 ttcccttcccttcccttcccttcccttccctt 202
||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 110019 ttcccttcccttcccttcccttcccttccctt 110050
Score = 63.9 bits (32), Expect = 9e-008
Identities = 32/32 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 136 ttcccttcccttcccttcccttcccttccctt 167
||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 110019 ttcccttcccttcccttcccttcccttccctt 110050
Score = 63.9 bits (32), Expect = 9e-008
Identities = 32/32 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 131 ttcccttcccttcccttcccttcccttccctt 162
||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 110019 ttcccttcccttcccttcccttcccttccctt 110050
Score = 63.9 bits (32), Expect = 9e-008
Identities = 32/32 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 156 ttcccttcccttcccttcccttcccttccctt 187
||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 110019 ttcccttcccttcccttcccttcccttccctt 110050
Score = 63.9 bits (32), Expect = 9e-008
Identities = 32/32 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 151 ttcccttcccttcccttcccttcccttccctt 182
||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 110019 ttcccttcccttcccttcccttcccttccctt 110050
Score = 58.0 bits (29), Expect = 5e-006
Identities = 29/29 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 129 ccttcccttcccttcccttcccttccctt 157
|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 110022 ccttcccttcccttcccttcccttccctt 110050
>emb|AL163280.2|HS21C080 Homo sapiens chromosome 21 segment HS21C080
Length = 340000
Score = 176 bits (89), Expect = 9e-042
Identities = 96/97 (98%), Gaps = 1/97 (1%)
Strand = Plus / Plus
Query: 126 cttccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttccc 185
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Sbjct: 86828 cttccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttccc 86887
Query: 186 ttcccttcccttcccttccctttcccttcccttccct 222
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 86888 ttcccttcccttcccttccc-ttcccttcccttccct 86923
Score = 170 bits (86), Expect = 5e-040
Identities = 93/94 (98%), Gaps = 1/94 (1%)
Strand = Plus / Plus
Query: 129 ccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttc 188
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 86737 ccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttc 86796
Query: 189 ccttcccttcccttccctttcccttcccttccct 222
||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 86797 ccttcccttcccttccc-ttcccttcccttccct 86829
Score = 170 bits (86), Expect = 5e-040
Identities = 93/94 (98%), Gaps = 1/94 (1%)
Strand = Plus / Plus
Query: 129 ccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttc 188
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 86901 ccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttc 86960
Query: 189 ccttcccttcccttccctttcccttcccttccct 222
||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 86961 ccttcccttcccttccc-ttcccttcccttccct 86993
Score = 170 bits (86), Expect = 5e-040
Identities = 93/94 (98%), Gaps = 1/94 (1%)
Strand = Plus / Plus
Query: 129 ccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttc 188
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Sbjct: 86717 ccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttc 86776
Query: 189 ccttcccttcccttccctttcccttcccttccct 222
||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 86777 ccttcccttcccttccc-ttcccttcccttccct 86809
Score = 170 bits (86), Expect = 5e-040
Identities = 93/94 (98%), Gaps = 1/94 (1%)
Strand = Plus / Plus
Query: 129 ccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttc 188
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Sbjct: 86732 ccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttc 86791
Query: 189 ccttcccttcccttccctttcccttcccttccct 222
||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 86792 ccttcccttcccttccc-ttcccttcccttccct 86824
Score = 170 bits (86), Expect = 5e-040
Identities = 93/94 (98%), Gaps = 1/94 (1%)
Strand = Plus / Plus
Query: 129 ccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttc 188
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Sbjct: 86896 ccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttc 86955
Query: 189 ccttcccttcccttccctttcccttcccttccct 222
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Sbjct: 86956 ccttcccttcccttccc-ttcccttcccttccct 86988
Score = 170 bits (86), Expect = 5e-040
Identities = 93/94 (98%), Gaps = 1/94 (1%)
Strand = Plus / Plus
Query: 129 ccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttc 188
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Sbjct: 86916 ccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttc 86975
Query: 189 ccttcccttcccttccctttcccttcccttccct 222
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Sbjct: 86976 ccttcccttcccttccc-ttcccttcccttccct 87008
Score = 170 bits (86), Expect = 5e-040
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Strand = Plus / Plus
Query: 129 ccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttc 188
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Sbjct: 86921 ccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttc 86980
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Sbjct: 86981 ccttcccttcccttccc-ttcccttcccttccct 87013
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Identities = 93/94 (98%), Gaps = 1/94 (1%)
Strand = Plus / Plus
Query: 129 ccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttc 188
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Sbjct: 86926 ccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttc 86985
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Sbjct: 86986 ccttcccttcccttccc-ttcccttcccttccct 87018
Score = 170 bits (86), Expect = 5e-040
Identities = 93/94 (98%), Gaps = 1/94 (1%)
Strand = Plus / Plus
Query: 129 ccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttc 188
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Sbjct: 86846 ccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttc 86905
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Sbjct: 86906 ccttcccttcccttccc-ttcccttcccttccct 86938
Score = 170 bits (86), Expect = 5e-040
Identities = 93/94 (98%), Gaps = 1/94 (1%)
Strand = Plus / Plus
Query: 129 ccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttc 188
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Sbjct: 86861 ccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttc 86920
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Sbjct: 86921 ccttcccttcccttccc-ttcccttcccttccct 86953
Score = 170 bits (86), Expect = 5e-040
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Strand = Plus / Plus
Query: 129 ccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttc 188
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Sbjct: 86881 ccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttc 86940
Query: 189 ccttcccttcccttccctttcccttcccttccct 222
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Sbjct: 86941 ccttcccttcccttccc-ttcccttcccttccct 86973
Score = 170 bits (86), Expect = 5e-040
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Strand = Plus / Plus
Query: 129 ccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttc 188
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Sbjct: 86866 ccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttc 86925
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Sbjct: 86926 ccttcccttcccttccc-ttcccttcccttccct 86958
Score = 165 bits (83), Expect = 3e-038
Identities = 92/94 (97%), Gaps = 2/94 (2%)
Strand = Plus / Plus
Query: 129 ccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttc 188
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Sbjct: 86752 ccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttc 86811
Query: 189 ccttcccttcccttccctttcccttcccttccct 222
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Sbjct: 86812 ccttcccttcccttccctt--ccttcccttccct 86843
Score = 165 bits (83), Expect = 3e-038
Identities = 90/91 (98%), Gaps = 1/91 (1%)
Strand = Plus / Plus
Query: 132 tcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttccct 191
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Sbjct: 86715 tcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttccct 86774
Query: 192 tcccttcccttccctttcccttcccttccct 222
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Sbjct: 86775 tcccttcccttccc-ttcccttcccttccct 86804
Score = 159 bits (80), Expect = 2e-036
Identities = 80/80 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 129 ccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttc 188
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Sbjct: 86941 ccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttc 87000
Query: 189 ccttcccttcccttcccttt 208
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Sbjct: 87001 ccttcccttcccttcccttt 87020
Score = 71.9 bits (36), Expect = 4e-010
Identities = 48/52 (92%)
Strand = Plus / Minus
Query: 135 cttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttccct 186
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Sbjct: 319421 cttcccttcccttcccttctcttcccttcctttcccttccctcccctcccct 319370
Score = 71.9 bits (36), Expect = 4e-010
Identities = 48/52 (92%)
Strand = Plus / Minus
Query: 130 cttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttccct 181
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Sbjct: 319421 cttcccttcccttcccttctcttcccttcctttcccttccctcccctcccct 319370
Score = 71.9 bits (36), Expect = 4e-010
Identities = 48/52 (92%)
Strand = Plus / Minus
Query: 140 cttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttccct 191
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Sbjct: 319421 cttcccttcccttcccttctcttcccttcctttcccttccctcccctcccct 319370
Score = 71.9 bits (36), Expect = 4e-010
Identities = 48/52 (92%)
Strand = Plus / Minus
Query: 145 cttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttccct 196
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Sbjct: 319421 cttcccttcccttcccttctcttcccttcctttcccttccctcccctcccct 319370
Score = 71.9 bits (36), Expect = 4e-010
Identities = 48/52 (92%)
Strand = Plus / Minus
Query: 150 cttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttccct 201
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Sbjct: 319421 cttcccttcccttcccttctcttcccttcctttcccttccctcccctcccct 319370
Score = 71.9 bits (36), Expect = 4e-010
Identities = 48/52 (92%)
Strand = Plus / Minus
Query: 155 cttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttccct 206
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Sbjct: 319421 cttcccttcccttcccttctcttcccttcctttcccttccctcccctcccct 319370
Score = 63.9 bits (32), Expect = 9e-008
Identities = 45/48 (93%), Gaps = 1/48 (2%)
Strand = Plus / Minus
Query: 175 cttcccttcccttcccttcccttcccttccctttcccttcccttccct 222
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Sbjct: 319421 cttcccttcccttcccttctcttcccttcc-tttcccttccctcccct 319375
Score = 63.9 bits (32), Expect = 9e-008
Identities = 44/48 (91%)
Strand = Plus / Minus
Query: 129 ccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttccct 176
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Sbjct: 319417 ccttcccttcccttctcttcccttcctttcccttccctcccctcccct 319370
Score = 60.0 bits (30), Expect = 1e-006
Identities = 36/38 (94%)
Strand = Plus / Minus
Query: 170 cttcccttcccttcccttcccttcccttcccttccctt 207
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Sbjct: 319421 cttcccttcccttcccttctcttcccttcctttccctt 319384
>emb|AL670285.10| Mouse DNA sequence from clone RP23-308N2 on chromosome 4, complete
sequence
Length = 173935
Score = 176 bits (89), Expect = 9e-042
Identities = 96/97 (98%), Gaps = 1/97 (1%)
Strand = Plus / Plus
Query: 126 cttccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttccc 185
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Sbjct: 13700 cttccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttccc 13759
Query: 186 ttcccttcccttcccttccctttcccttcccttccct 222
|||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct: 13760 ttcccttcccttcccttccc-ttcccttcccttccct 13795
Score = 170 bits (86), Expect = 5e-040
Identities = 93/94 (98%), Gaps = 1/94 (1%)
Strand = Plus / Plus
Query: 129 ccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttc 188
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Sbjct: 13733 ccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttc 13792
Query: 189 ccttcccttcccttccctttcccttcccttccct 222
|||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct: 13793 ccttcccttcccttcccttt-ccttcccttccct 13825
Score = 170 bits (86), Expect = 5e-040
Identities = 93/94 (98%), Gaps = 1/94 (1%)
Strand = Plus / Plus
Query: 129 ccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttc 188
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Sbjct: 13718 ccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttc 13777
Query: 189 ccttcccttcccttccctttcccttcccttccct 222
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Sbjct: 13778 ccttcccttcccttccc-ttcccttcccttccct 13810
Score = 163 bits (82), Expect = 1e-037
Identities = 92/94 (97%), Gaps = 1/94 (1%)
Strand = Plus / Plus
Query: 129 ccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttc 188
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Sbjct: 13738 ccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttc 13797
Query: 189 ccttcccttcccttccctttcccttcccttccct 222
|||||||||||||| |||| ||||||||||||||
Sbjct: 13798 ccttcccttccctttcctt-cccttcccttccct 13830
Score = 151 bits (76), Expect = 5e-034
Identities = 79/80 (98%)
Strand = Plus / Plus
Query: 129 ccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttc 188
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Sbjct: 13753 ccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttcccttt 13812
Query: 189 ccttcccttcccttcccttt 208
||||||||||||||||||||
Sbjct: 13813 ccttcccttcccttcccttt 13832
Database: All GenBank+EMBL+DDBJ+PDB sequences (but no EST, STS, GSS,
or phase 0, 1 or 2 HTGS sequences)
Posted date: Dec 22, 2002 5:05 AM
Number of letters in database: -1,032,325,963
Number of sequences in database: 1,542,558
Lambda K H
1.37 0.711 0.000
Gapped
Lambda K H
1.37 0.711 4.94e-324
Matrix: blastn matrix:1 -3
Gap Penalties: Existence: 5, Extension: 2
Number of Hits to DB: 3,362,070
Number of Sequences: 1542558
Number of extensions: 3362070
Number of successful extensions: 305991
Number of sequences better than 1.0e-05: 1649
Number of HSP's better than 0.0 without gapping: 1485
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length of query: 226
length of database: 7,557,608,625
effective HSP length: 20
effective length of query: 206
effective length of database: 7,526,757,465
effective search space: 1550512037790
effective search space used: 1550512037790
T: 0
A: 0
X1: 6 (11.9 bits)
X2: 15 (29.7 bits)
S1: 12 (24.3 bits)
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